264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0016 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0016  YceI-like family protein  100 
 
 
328 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1185  YceI like family protein  99.09 
 
 
328 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1156  hypothetical protein  99.09 
 
 
328 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0144  hypothetical protein  99.09 
 
 
328 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0826223  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1502  YceI like family protein  99.09 
 
 
328 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1415  hypothetical protein  99.09 
 
 
328 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264366  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0423  YceI like family protein  98.62 
 
 
289 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1385  YceI like family protein  61.56 
 
 
243 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00309571  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  51.61 
 
 
216 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  50 
 
 
216 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  50.43 
 
 
211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  51.26 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  50.83 
 
 
217 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  50.83 
 
 
199 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  50.83 
 
 
217 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  50.83 
 
 
199 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  50.83 
 
 
199 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  50.83 
 
 
217 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  50 
 
 
185 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  38.1 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.45 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  35.77 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.61 
 
 
196 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  31.9 
 
 
201 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.09 
 
 
195 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  30.99 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  37.3 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  25 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  28.95 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  28.95 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  38.02 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  27.34 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  29.45 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  28.21 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  26.62 
 
 
196 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  35.29 
 
 
183 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.62 
 
 
219 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  31.03 
 
 
201 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  27.66 
 
 
200 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.31 
 
 
201 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.45 
 
 
183 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  35.04 
 
 
201 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  31.74 
 
 
232 aa  63.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  30.17 
 
 
201 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.66 
 
 
205 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  30.17 
 
 
201 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.26 
 
 
214 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  32.76 
 
 
182 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.03 
 
 
186 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.61 
 
 
183 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  30.43 
 
 
192 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  34.43 
 
 
201 aa  62.8  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  30.88 
 
 
189 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  30.43 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  35.77 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  33.08 
 
 
183 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  28.87 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  34.48 
 
 
204 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  27.12 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  35.66 
 
 
182 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2329  YceI family protein  31.29 
 
 
211 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664269  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  28.36 
 
 
192 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  29.1 
 
 
201 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  24.81 
 
 
182 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  28.36 
 
 
192 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  34.59 
 
 
189 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  28.36 
 
 
192 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  29.25 
 
 
202 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  25.86 
 
 
189 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  27.61 
 
 
188 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  28.36 
 
 
204 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  30.25 
 
 
212 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  29.92 
 
 
211 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  31.86 
 
 
223 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  30.25 
 
 
176 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  31.62 
 
 
187 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  28.81 
 
 
197 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  28.81 
 
 
197 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  31.51 
 
 
179 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  28.36 
 
 
177 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  31.45 
 
 
178 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  26.83 
 
 
186 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  31.78 
 
 
182 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  34.11 
 
 
181 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  28.68 
 
 
175 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  28.67 
 
 
206 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  35.66 
 
 
181 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  28.06 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  28.33 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  27.73 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  28.08 
 
 
191 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  26.72 
 
 
191 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  27.61 
 
 
176 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  31.86 
 
 
201 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  27.73 
 
 
237 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  27.42 
 
 
190 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  29.33 
 
 
189 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  30.97 
 
 
201 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  29.31 
 
 
198 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>