More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1850 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
314 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
314 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
314 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
314 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
361 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
314 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
336 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  94.9 
 
 
361 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  79.3 
 
 
314 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  79.3 
 
 
314 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  78.66 
 
 
314 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  78.66 
 
 
314 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  78.34 
 
 
326 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  77.39 
 
 
314 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  77.39 
 
 
314 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  73.95 
 
 
317 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  73.55 
 
 
331 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  73.4 
 
 
341 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  61.61 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  61.61 
 
 
336 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  61.61 
 
 
336 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  61.02 
 
 
314 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  60 
 
 
325 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  59.55 
 
 
315 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  59.35 
 
 
319 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  59.35 
 
 
315 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  57.88 
 
 
316 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  44.9 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  48.25 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  43.67 
 
 
331 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
332 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  43.04 
 
 
364 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 
353 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
368 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
332 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  41.94 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 
367 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 
367 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  41.85 
 
 
367 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 
332 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
368 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
368 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
368 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 
368 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  41.94 
 
 
367 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  41.61 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  41.21 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
355 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
355 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  42.58 
 
 
375 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 
345 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 
332 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
332 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 
339 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 
340 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  41.03 
 
 
337 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  43.04 
 
 
341 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  44.19 
 
 
331 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  43.61 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  43.61 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  43.61 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.02 
 
 
334 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  42.31 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
336 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  38.24 
 
 
318 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
338 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  44.69 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 
331 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  43.61 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  40.2 
 
 
335 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  44.37 
 
 
371 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 
341 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 
371 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 
371 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 
341 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
340 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  43.23 
 
 
338 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
341 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
322 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.39 
 
 
343 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  43.28 
 
 
332 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  43 
 
 
332 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 
338 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
321 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>