More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3075 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
243 aa  470  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
362 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
362 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
362 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  98.38 
 
 
347 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  97.98 
 
 
366 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  98.38 
 
 
366 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  96.3 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.83 
 
 
298 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.82 
 
 
300 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  83.33 
 
 
300 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.17 
 
 
312 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.42 
 
 
298 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.3 
 
 
298 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  88.07 
 
 
298 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.24 
 
 
300 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.24 
 
 
300 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.24 
 
 
300 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.49 
 
 
265 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.62 
 
 
265 aa  328  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  71.18 
 
 
265 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  65.97 
 
 
291 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.52 
 
 
261 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.81 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.4 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.87 
 
 
261 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  60.7 
 
 
261 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.11 
 
 
262 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.45 
 
 
265 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.88 
 
 
294 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.4 
 
 
266 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.51 
 
 
264 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  63.03 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00110867  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  34.84 
 
 
281 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
280 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  33.77 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
272 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
304 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7601  ABC transporter membrane spanning protein  33.76 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
279 aa  89  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
266 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.04 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 
300 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7195  ABC transporter permease  32.42 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
276 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  33.68 
 
 
282 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
282 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.225733  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.15 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  32.29 
 
 
284 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
278 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.722828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.04 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  30.26 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  29.8 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3185  ABC transporter permease  33.19 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  0.45751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  30.67 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  29.61 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.83 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.83 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.83 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>