More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0995 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1799  transposase  98.2 
 
 
507 aa  999    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  98 
 
 
507 aa  999    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  100 
 
 
500 aa  1018    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  51.12 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  51.12 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  41.74 
 
 
494 aa  299  7e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  38.64 
 
 
464 aa  269  7e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  31.86 
 
 
504 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  31.86 
 
 
504 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  31.39 
 
 
501 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  42.27 
 
 
309 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  42.27 
 
 
309 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  42.05 
 
 
323 aa  208  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  41.92 
 
 
309 aa  204  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  31.05 
 
 
501 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  31.05 
 
 
501 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  31.05 
 
 
501 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  31.05 
 
 
501 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  32.7 
 
 
501 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  31.81 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  35.76 
 
 
334 aa  176  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  33.16 
 
 
502 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  32.58 
 
 
497 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  29.69 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  30.3 
 
 
499 aa  163  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  30.3 
 
 
499 aa  163  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  30.3 
 
 
499 aa  163  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  31.46 
 
 
498 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  29.98 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  29.98 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  29.98 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  29.98 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  31.12 
 
 
501 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  31.12 
 
 
501 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  28.64 
 
 
504 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  30.77 
 
 
507 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  30.77 
 
 
507 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  30.77 
 
 
507 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  30.77 
 
 
507 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  30.54 
 
 
488 aa  140  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  29.23 
 
 
507 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  28.34 
 
 
499 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  28.34 
 
 
499 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  28.34 
 
 
499 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  30.56 
 
 
497 aa  136  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  29.5 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  29.5 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  29.74 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
499 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
499 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  28.07 
 
 
499 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  28.07 
 
 
499 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  29.67 
 
 
505 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  29.67 
 
 
505 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  29.67 
 
 
505 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  29.67 
 
 
505 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  29.5 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  32.15 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  26.95 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  29.8 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  29.8 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  29.8 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  28.23 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  28.23 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  27.38 
 
 
496 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 
501 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  27.8 
 
 
499 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  28.19 
 
 
504 aa  124  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  25.05 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  28.5 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  27.91 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  27.91 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  29.94 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  28.21 
 
 
501 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  27.83 
 
 
503 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  27.83 
 
 
503 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  25.21 
 
 
504 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>