More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0836 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  72.63 
 
 
843 aa  1207    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  62.82 
 
 
843 aa  1066    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  46.14 
 
 
837 aa  742    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  66.51 
 
 
837 aa  1130    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  44.96 
 
 
846 aa  731    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  61.08 
 
 
836 aa  973    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  100 
 
 
862 aa  1750    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  37 
 
 
860 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.44 
 
 
834 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.29 
 
 
838 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  37.56 
 
 
843 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.24 
 
 
838 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.08 
 
 
838 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.91 
 
 
877 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  34.86 
 
 
853 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.21 
 
 
843 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  36.12 
 
 
848 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  36.12 
 
 
848 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  36.48 
 
 
863 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  34.7 
 
 
844 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  36.01 
 
 
848 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.18 
 
 
850 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  35.81 
 
 
861 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.08 
 
 
822 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  36.62 
 
 
851 aa  475  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.91 
 
 
838 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  37.66 
 
 
776 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  34.71 
 
 
950 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  34.94 
 
 
885 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  34.43 
 
 
897 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  32.24 
 
 
820 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.44 
 
 
832 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  36.73 
 
 
833 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  34.67 
 
 
899 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  34.99 
 
 
2017 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  36.73 
 
 
964 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  35.64 
 
 
953 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  36.18 
 
 
944 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  34.97 
 
 
827 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 
1896 aa  452  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 
947 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  31.28 
 
 
823 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  34.52 
 
 
894 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  34.2 
 
 
1840 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  35.57 
 
 
880 aa  446  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  33.44 
 
 
899 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  37.6 
 
 
916 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  35.57 
 
 
941 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  37.34 
 
 
845 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  36.76 
 
 
946 aa  439  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  36.66 
 
 
946 aa  438  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  37.98 
 
 
971 aa  439  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  38.27 
 
 
916 aa  438  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  33.19 
 
 
898 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  33.94 
 
 
942 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  36.21 
 
 
952 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  35.73 
 
 
941 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  35.95 
 
 
931 aa  438  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  33.84 
 
 
939 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  32.87 
 
 
898 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  35.68 
 
 
954 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  35.46 
 
 
957 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  37.09 
 
 
952 aa  434  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  35.11 
 
 
945 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  35.26 
 
 
934 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  34.53 
 
 
954 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  36.85 
 
 
945 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  36.64 
 
 
966 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2343  excinuclease ABC, A subunit  36.26 
 
 
1004 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.684635  decreased coverage  0.00406706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  36.91 
 
 
946 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  36.13 
 
 
960 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  35.94 
 
 
944 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  34.59 
 
 
944 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  33.72 
 
 
881 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  36.78 
 
 
954 aa  432  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  34.53 
 
 
954 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  36.5 
 
 
966 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  37.02 
 
 
946 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  35.71 
 
 
948 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  36.5 
 
 
965 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  34.64 
 
 
943 aa  428  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  35.72 
 
 
946 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
792 aa  429  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  37.17 
 
 
946 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  36.23 
 
 
955 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  36.9 
 
 
947 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  35.71 
 
 
948 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  34.26 
 
 
951 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1015  excinuclease ABC subunit A  35.6 
 
 
977 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.198775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  36.29 
 
 
946 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  34.61 
 
 
937 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  34.55 
 
 
944 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  36.13 
 
 
987 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  35.8 
 
 
988 aa  426  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3893  excinuclease ABC subunit A  35.29 
 
 
957 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0968231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  35.81 
 
 
973 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  33.51 
 
 
958 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  33.51 
 
 
958 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3843  excinuclease ABC subunit A  35.15 
 
 
957 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1662  excinuclease ABC subunit A  35.35 
 
 
958 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>