More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0641 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0641  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 450 aa  884    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0564  histidine kinase  38.04 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 358 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10700  signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0148  histidine kinase-related ATPase, putative  23.5 
 
 		 289 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  32.85 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  24.86 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  28.46 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  24.48 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30 
 
 		 466 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  25.48 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  27.04 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.62 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.81 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  28.76 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  27.5 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  28.26 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  24.68 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  26 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  28.29 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  28.12 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  28.71 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.62 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  23.44 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  29.35 
 
 		 591 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  23.82 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.42 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  29.91 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  23.77 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  28.65 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  28.21 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  31.95 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  27.73 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0638  histidine kinase  28.83 
 
 		 381 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  24.07 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122889  hitchhiker  0.0000562905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  27.46 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  29.82 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 614 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  21.92 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  27.24 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  31.25 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  27.41 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  23.02 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  28.47 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.67 
 
 		 598 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  30.97 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  25.98 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.92 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 584 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.29 
 
 		 598 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>