More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0303 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1934  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.8 
 
 		 855 aa  868    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.621213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14430  DNA topoisomerase IV subunit A  51.28 
 
 		 822 aa  817    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0776832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13190  DNA topoisomerase IV subunit A  49.78 
 
 		 868 aa  796    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165403  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15900  DNA topoisomerase IV subunit A  50.33 
 
 		 823 aa  811    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0201184  normal  0.219646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  49.78 
 
 		 831 aa  815    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7080  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.45 
 
 		 831 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0699  DNA gyrase/topoisomerase IV, A subunit  70.59 
 
 		 887 aa  1255    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08230  DNA topoisomerase IV subunit A  47.42 
 
 		 827 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1546  DNA topoisomerase IV subunit A  50.33 
 
 		 826 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0628876  normal  0.0572906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  50.95 
 
 		 841 aa  806    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0303  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 909 aa  1842    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.821853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1681  DNA topoisomerase IV subunit A  45.85 
 
 		 827 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.638406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1618  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.99 
 
 		 833 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1928  DNA topoisomerase IV subunit A  52.46 
 
 		 819 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.769322  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1772  DNA topoisomerase IV subunit A  49.16 
 
 		 820 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  51.27 
 
 		 836 aa  871    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.94 
 
 		 828 aa  811    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1627  DNA topoisomerase IV subunit A  52.02 
 
 		 832 aa  850    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  53.59 
 
 		 828 aa  904    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  49.55 
 
 		 813 aa  783    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16040  DNA topoisomerase IV subunit A  55.95 
 
 		 824 aa  931    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  49.11 
 
 		 826 aa  746    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2281  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.16 
 
 		 1143 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1675  DNA topoisomerase IV subunit A  46.07 
 
 		 827 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.898685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1693  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.95 
 
 		 826 aa  924    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0385634  normal  0.564105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  38.42 
 
 		 820 aa  532  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  38.34 
 
 		 866 aa  528  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  37.11 
 
 		 870 aa  523  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  37.66 
 
 		 932 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  36.6 
 
 		 807 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  37.95 
 
 		 901 aa  518  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  37.07 
 
 		 839 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  38.56 
 
 		 802 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  36.95 
 
 		 839 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  36.12 
 
 		 823 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  52.29 
 
 		 834 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  53.07 
 
 		 816 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  35.75 
 
 		 818 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  36.64 
 
 		 841 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  35.65 
 
 		 834 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  37.18 
 
 		 848 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  51.35 
 
 		 809 aa  505  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  38.09 
 
 		 856 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0006  DNA gyrase, A subunit  41.96 
 
 		 816 aa  505  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0008  DNA gyrase, A subunit  36.2 
 
 		 819 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  36.85 
 
 		 836 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  37.71 
 
 		 812 aa  505  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  52.82 
 
 		 848 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  52.04 
 
 		 825 aa  505  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  36.44 
 
 		 837 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  50.91 
 
 		 864 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  35.85 
 
 		 870 aa  502  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  35.81 
 
 		 806 aa  501  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  51.33 
 
 		 863 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  50.8 
 
 		 818 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  36.88 
 
 		 839 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  36.99 
 
 		 839 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  36.95 
 
 		 853 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  36.58 
 
 		 809 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  38.71 
 
 		 816 aa  499  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  50.92 
 
 		 865 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  35.89 
 
 		 823 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  36.19 
 
 		 834 aa  499  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  36.2 
 
 		 875 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  36.3 
 
 		 831 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  52.16 
 
 		 824 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  36 
 
 		 823 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  50.73 
 
 		 893 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  45.34 
 
 		 853 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  36.45 
 
 		 839 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2002  DNA gyrase, A subunit  36.25 
 
 		 838 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0412801  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  52.51 
 
 		 814 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  51.26 
 
 		 809 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  51.47 
 
 		 809 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  51.45 
 
 		 809 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  36.68 
 
 		 796 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  35.78 
 
 		 823 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  50.72 
 
 		 865 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  51.26 
 
 		 809 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  35.62 
 
 		 889 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  38.04 
 
 		 883 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  37.46 
 
 		 822 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  36.49 
 
 		 827 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  37.94 
 
 		 808 aa  490  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  36.6 
 
 		 819 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  35.99 
 
 		 852 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  35.47 
 
 		 829 aa  492  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  35.62 
 
 		 889 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  49.69 
 
 		 863 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  36 
 
 		 819 aa  488  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  36.58 
 
 		 875 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  35.02 
 
 		 834 aa  489  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  37.66 
 
 		 899 aa  489  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.93 
 
 		 836 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>