More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7769 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7769  adenylate kinase  100 
 
 		 185 aa  362  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  51.43 
 
 		 309 aa  174  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  54.07 
 
 		 367 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  51.98 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  50.29 
 
 		 360 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  48.26 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  48.26 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  48.26 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  49.14 
 
 		 341 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  51.43 
 
 		 335 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  51.41 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  50.58 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  51.45 
 
 		 195 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  49.13 
 
 		 193 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  48.6 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  47.13 
 
 		 205 aa  158  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  49.13 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  51.16 
 
 		 206 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  48.84 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  48.84 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  50.59 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  47.4 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  48.26 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  43.15 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  47.43 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  41.12 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  44 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  41.12 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  47.09 
 
 		 205 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  41.75 
 
 		 224 aa  140  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  40.72 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  41.27 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  43.35 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  42.05 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  43.43 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  43.93 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  39.69 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  40 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  39.15 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  38.14 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  37.63 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  38.02 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  42.44 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  38.74 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  40.21 
 
 		 229 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  37.76 
 
 		 216 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  38.69 
 
 		 215 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  38.69 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  35.05 
 
 		 217 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  38.38 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  38.46 
 
 		 216 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  39.68 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03420  adenylate kinase, putative  38.66 
 
 		 269 aa  127  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  38.97 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  37.5 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  38.97 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  40.21 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  38.66 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  36.6 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  42.24 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65737  Adenylate kinase (ATP-AMP transphosphorylase)  39.09 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  40.72 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  41.38 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  41.38 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  38.14 
 
 		 217 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  38.42 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  36.6 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  39.25 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  41.04 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  40.24 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  37.31 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  37.04 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  36.41 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.6 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  38.95 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  39.53 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  35.37 
 
 		 374 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  38.74 
 
 		 423 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  36.95 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  36.95 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  40.12 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  40.21 
 
 		 215 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  35.5 
 
 		 215 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  36.7 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  39.47 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  43.84 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  38.1 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  37.7 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  33.85 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  36.79 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  40.72 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  35.75 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  36.68 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  41.86 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  37.17 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  36.08 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  39.29 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  39.29 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  37.69 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>