More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7661 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7661  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  613  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1256  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0775  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4399  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1228  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74553  normal  0.563903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1135  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6126  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1147  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.451163  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  33.95 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  33.95 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  33.33 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0657  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  30.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.48 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  32.58 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  30.32 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  30.32 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  30.32 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.95 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.51 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  31.75 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3766  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  30 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  30 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  31.02 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  31.02 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  31.02 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  31.02 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  31.02 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>