142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7497 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  100 
 
 		 379 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  66.05 
 
 		 381 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  51.62 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  44.18 
 
 		 379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  43.77 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  43.92 
 
 		 761 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  44.5 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.19 
 
 		 771 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.08 
 
 		 771 aa  295  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  43.16 
 
 		 384 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.36 
 
 		 772 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.84 
 
 		 782 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.46 
 
 		 791 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.35 
 
 		 764 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.71 
 
 		 790 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.31 
 
 		 776 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.95 
 
 		 761 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.07 
 
 		 791 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.19 
 
 		 790 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.79 
 
 		 775 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.6 
 
 		 790 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.3 
 
 		 777 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.16 
 
 		 785 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.38 
 
 		 764 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.95 
 
 		 789 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.49 
 
 		 777 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.9 
 
 		 782 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.61 
 
 		 790 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.79 
 
 		 822 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.95 
 
 		 780 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.89 
 
 		 792 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.89 
 
 		 792 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.83 
 
 		 778 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  40.63 
 
 		 413 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  40.63 
 
 		 413 aa  255  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.34 
 
 		 804 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  37.47 
 
 		 782 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.4 
 
 		 774 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.62 
 
 		 752 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.69 
 
 		 784 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  41.21 
 
 		 413 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  38.38 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  38.52 
 
 		 712 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  37.39 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  34.18 
 
 		 451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  29.33 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  24.67 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  26.13 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  26.94 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  25.6 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.6 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  24.22 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  24.41 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  27.65 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  27.25 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  22.85 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  23.97 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  24.78 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.27 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  23.88 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  22.83 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  25.49 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.29 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  24.82 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  24.8 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  24.82 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  24.8 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  24.8 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  24.82 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  23.2 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  25.68 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.86 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  23.97 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  21.7 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  23.79 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  23.81 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2304  monooxygenase FAD-binding  41.56 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  24.51 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  24.64 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  27.18 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  24.23 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  25.94 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09700  putative monooxygenase  26.3 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  28 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  23.94 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  32.26 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  23.61 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  25.58 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.04 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  25.58 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  25.58 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  24.62 
 
 		 399 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  39.13 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>