More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7139 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7139  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 160 aa  319  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.876288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3619  CinA-like  72.15 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.45601  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1678  CinA-like  70.62 
 
 		 163 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1897  CinA domain protein  73.55 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3350  CinA domain-containing protein  64.08 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2030  CinA domain protein  52.7 
 
 		 174 aa  156  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1740  competence/damage-inducible protein cinA  48.72 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1417  CinA domain-containing protein  41.1 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.58 
 
 		 430 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.84 
 
 		 430 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 424 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  35.1 
 
 		 417 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 400 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  40.95 
 
 		 419 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32786  predicted protein  32.95 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  0.784272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.26 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  41.53 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.9 
 
 		 431 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 429 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  39.34 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.26 
 
 		 418 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 		 413 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  41.03 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  37.5 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  41.51 
 
 		 406 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  34.84 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  30.52 
 
 		 416 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  32.81 
 
 		 416 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.83 
 
 		 433 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  33.54 
 
 		 418 aa  77.4  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  36.97 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  38.4 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  31.41 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  35 
 
 		 421 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.45 
 
 		 418 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  36.96 
 
 		 408 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  41.73 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  34.64 
 
 		 420 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  31.17 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  32.67 
 
 		 413 aa  73.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  36.23 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.39 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.78 
 
 		 415 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  35.71 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  29.27 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  33.58 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  40.16 
 
 		 426 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  36.05 
 
 		 410 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 		 411 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  37 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  37.86 
 
 		 411 aa  71.2  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  36.44 
 
 		 413 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  34.62 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 420 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  33.87 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  34.62 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.65 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  29.22 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  29.57 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  37.96 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  42.55 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  37.4 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  33.33 
 
 		 431 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  39.37 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  29.38 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  39.32 
 
 		 422 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  37.76 
 
 		 416 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  32.41 
 
 		 411 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 432 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  38.28 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  34.65 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  31.41 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  37.4 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  31.52 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.06 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  38.81 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  38.79 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  34.65 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  33.8 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  34.65 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  32.67 
 
 		 408 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  30.32 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  34.71 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  33.04 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  30.32 
 
 		 416 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  31.11 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  35.29 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  32.05 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  34.06 
 
 		 413 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  29.41 
 
 		 423 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  35.2 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  31.41 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0343  CinA domain protein  37.04 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  28.57 
 
 		 417 aa  63.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  34.31 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  33.67 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  28.3 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  36.76 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  36.05 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  35.58 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>