More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4483 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.03 
 
 
265 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.65 
 
 
281 aa  410  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.38 
 
 
264 aa  407  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.03 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.64 
 
 
272 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.62 
 
 
265 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  72.9 
 
 
271 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.37 
 
 
265 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.5 
 
 
271 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.38 
 
 
263 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.08 
 
 
268 aa  349  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.31 
 
 
266 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.69 
 
 
268 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.91 
 
 
270 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.5 
 
 
285 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.77 
 
 
266 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  66.79 
 
 
266 aa  339  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.29 
 
 
270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.64 
 
 
269 aa  332  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.08 
 
 
263 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.37 
 
 
278 aa  328  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  66.41 
 
 
288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.92 
 
 
271 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.06 
 
 
271 aa  324  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.22 
 
 
276 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.6 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.26 
 
 
285 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.18 
 
 
285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.79 
 
 
285 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.12 
 
 
270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.74 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.52 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.02 
 
 
295 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.31 
 
 
262 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.98 
 
 
270 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.34 
 
 
261 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.32 
 
 
263 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.63 
 
 
270 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.17 
 
 
264 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.79 
 
 
264 aa  275  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.79 
 
 
264 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.49 
 
 
262 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59 
 
 
264 aa  268  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.92 
 
 
264 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.51 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 
269 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.85 
 
 
265 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.92 
 
 
267 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.64 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.82 
 
 
263 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.79 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.36 
 
 
270 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.87 
 
 
266 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.13 
 
 
267 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.93 
 
 
278 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.39 
 
 
261 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.33 
 
 
262 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.16 
 
 
271 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.31 
 
 
267 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.66 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.57 
 
 
265 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 
278 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.33 
 
 
266 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.64 
 
 
268 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.42 
 
 
277 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.06 
 
 
267 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.95 
 
 
266 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.42 
 
 
277 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
261 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.22 
 
 
262 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.4 
 
 
278 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.17 
 
 
263 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.17 
 
 
263 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
261 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
261 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
261 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
261 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.61 
 
 
277 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
261 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
261 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 
266 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.78 
 
 
264 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 
261 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52 
 
 
278 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.97 
 
 
261 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
261 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.97 
 
 
261 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.82 
 
 
265 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
261 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
261 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 
271 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.31 
 
 
267 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  51.75 
 
 
268 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.8 
 
 
278 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.18 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.78 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.47 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>