More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3965 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  100 
 
 		 387 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  68.3 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  65.54 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  67.62 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  66.41 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  66.41 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  63.05 
 
 		 393 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  51.32 
 
 		 405 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  50.66 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  50.9 
 
 		 390 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  50.92 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  50.65 
 
 		 400 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  51.95 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  49.6 
 
 		 386 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  49.35 
 
 		 390 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  50.53 
 
 		 402 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  51.3 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  53 
 
 		 424 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  53.49 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  47.34 
 
 		 382 aa  308  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  51.99 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 393 aa  301  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  48.18 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  51.47 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.09 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  47.71 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  41.94 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  51.37 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  51.1 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  45.53 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.51 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.72 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.41 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.14 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.27 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  43.39 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.97 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  41.38 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.41 
 
 		 401 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  46.01 
 
 		 1139 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 1143 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  50 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  45.97 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.4 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  37.94 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.02 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.07 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  47.06 
 
 		 1135 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  45.09 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.98 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  46.67 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  49.18 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  47.73 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.3 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  47.34 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.83 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  48.54 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.46 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  37.14 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.26 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  44.12 
 
 		 422 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  44.2 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  45.53 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.59 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  47.06 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  41.11 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 533 aa  257  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.9 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.85 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  46.86 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.03 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.63 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  48.5 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.96 
 
 		 402 aa  252  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.59 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  45.58 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  42.09 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.9 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.43 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  44.93 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.58 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.47 
 
 		 393 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  42.66 
 
 		 400 aa  245  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  43.35 
 
 		 410 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  44.29 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.4 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>