48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1241 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1246    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  44.52 
 
 		 604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.12 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  27.57 
 
 		 619 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  24.95 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  25.1 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  26.92 
 
 		 600 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  27.05 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.81 
 
 		 615 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.89 
 
 		 608 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  25.88 
 
 		 606 aa  94.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.19 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.82 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.74 
 
 		 607 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.14 
 
 		 594 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.55 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  26.64 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.65 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  22.07 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  20 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.44 
 
 		 591 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.04 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.65 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  23.37 
 
 		 674 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.79 
 
 		 605 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  32.22 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.48 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.15 
 
 		 639 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  25.35 
 
 		 543 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.49 
 
 		 608 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.39 
 
 		 688 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.71 
 
 		 634 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  24.71 
 
 		 653 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  41.27 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.08 
 
 		 613 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  38.24 
 
 		 645 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.22 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.6 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  46.81 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  19.49 
 
 		 529 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  29.29 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  20.99 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.11 
 
 		 566 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  25.18 
 
 		 276 aa  44.3  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  29.2 
 
 		 712 aa  43.9  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  38.3 
 
 		 426 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>