More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1003 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  835    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4251  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2867  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2959  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5225  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.75 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  34.33 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.99 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  25.76 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.41 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.84 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  32.03 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  27.33 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  31.21 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0448  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.18 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.18 
 
 		 462 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 414 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  40.52 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  29.09 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.72 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  39.17 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>