225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0616 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 485 aa  998    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  50.46 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  48.05 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  48.55 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  48.95 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  47.59 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  46.79 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  44.83 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  47.14 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  50.37 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  47.38 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  42.96 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  44.24 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  47.33 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  47.94 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  42.62 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  46.67 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  46.21 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  46.88 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  43.78 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  44.18 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  48.97 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  42.41 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  45.19 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  30.92 
 
 		 555 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.58 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.34 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  31.4 
 
 		 368 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  29.05 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.02 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.4 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.53 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.83 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  29.44 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  29.61 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  31.7 
 
 		 407 aa  123  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.97 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.52 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.97 
 
 		 356 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.75 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  30.37 
 
 		 349 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.56 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  33.19 
 
 		 393 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  30.77 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.52 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.77 
 
 		 396 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  28.49 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.56 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  29.64 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29 
 
 		 411 aa  100  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  29.69 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.46 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.52 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.86 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  28.77 
 
 		 347 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.46 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.09 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.16 
 
 		 347 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.16 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  31.67 
 
 		 335 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  24.73 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.16 
 
 		 356 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  27.78 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.9 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.97 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.44 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  27.36 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.07 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  31.84 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.6 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.94 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.15 
 
 		 323 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  32.51 
 
 		 363 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  26.25 
 
 		 305 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  24.45 
 
 		 473 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  28.09 
 
 		 368 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.99 
 
 		 415 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.32 
 
 		 342 aa  90.9  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.25 
 
 		 422 aa  90.9  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.99 
 
 		 415 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.55 
 
 		 348 aa  90.5  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  27.41 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.73 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  25.46 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  29.29 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  28.74 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  30.47 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.31 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.31 
 
 		 325 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>