224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6159 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  954    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  59.04 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  54.59 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  55.17 
 
 		 453 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  56.87 
 
 		 446 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  54.24 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  54.32 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  54.57 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  54.57 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  53.4 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  55.13 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  55.63 
 
 		 450 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  52.18 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  53.37 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  50.96 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  50.24 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  49.88 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  50.49 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  49.39 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  51.56 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  48.64 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  46.92 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  46.76 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  50.37 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  47.31 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  31.54 
 
 		 555 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  32.08 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.81 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.64 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.15 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  28.92 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.19 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.79 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  30.2 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.76 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  30.84 
 
 		 368 aa  163  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  28.27 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  29.44 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.61 
 
 		 437 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  26.67 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  28.11 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.92 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.47 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.73 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  26.61 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.35 
 
 		 437 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.77 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  29.39 
 
 		 353 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.14 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.92 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  26.14 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  26.35 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.89 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.73 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.72 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.3 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  28.23 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.83 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.48 
 
 		 348 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  29.45 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  31.76 
 
 		 375 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.33 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.34 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.15 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.77 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.92 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  25.85 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  29 
 
 		 527 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  30.47 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.94 
 
 		 344 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.33 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.33 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.33 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.08 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.31 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  30.3 
 
 		 338 aa  103  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  24.85 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  31.22 
 
 		 356 aa  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  25.45 
 
 		 730 aa  103  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  27.47 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.39 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.17 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  27.49 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  24.85 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.21 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.61 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  25.29 
 
 		 708 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.84 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  28.05 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  25 
 
 		 730 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>