225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1404 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  100 
 
 		 434 aa  907    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  73.72 
 
 		 433 aa  696    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  54.8 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  54.01 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  52.33 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  53.54 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  51.86 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  53.3 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  51.5 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  51.98 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  53.4 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  53.98 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  51.3 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  49.53 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  50.59 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  49.65 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  51.69 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  49.05 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  50.9 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  47.69 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  42.54 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  45.13 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  47.11 
 
 		 470 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  45.52 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  42.76 
 
 		 485 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  33.87 
 
 		 493 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  34.5 
 
 		 555 aa  233  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.25 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.8 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.5 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.74 
 
 		 365 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  30.23 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.94 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  28.89 
 
 		 376 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.86 
 
 		 392 aa  166  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  26.97 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  27.55 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  26.4 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.11 
 
 		 437 aa  119  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.76 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.5 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.86 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.93 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  31.88 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  29.17 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.27 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  29.39 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.57 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.93 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.51 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.5 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.92 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.06 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  29.55 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.33 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.92 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.05 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  29.26 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.26 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  28.79 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.13 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  29.39 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  29.13 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  29.13 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.45 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  25.23 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  25.71 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.67 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.82 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.51 
 
 		 353 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  29.31 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.75 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.82 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.46 
 
 		 372 aa  106  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  29.07 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.82 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  25.15 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  24.85 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  24.92 
 
 		 730 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  24.61 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  30 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.16 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.87 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.88 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.43 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.16 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.87 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5091  hypothetical protein  27.24 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5769  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.24 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  27.63 
 
 		 414 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.77 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  25.11 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.53 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  25.99 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  26.19 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.51 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  29.67 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  24.29 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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