225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0272 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 453 aa  936    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  74.19 
 
 		 461 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  78.44 
 
 		 454 aa  754    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  75.79 
 
 		 446 aa  694    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  71.36 
 
 		 432 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  62.38 
 
 		 456 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
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NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  59.62 
 
 		 468 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
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NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  58.89 
 
 		 454 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  57.18 
 
 		 455 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  53.77 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  54.46 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  55.09 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  54.93 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  56.44 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  55.06 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  53.05 
 
 		 448 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  56.55 
 
 		 448 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  55.17 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
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NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  52.71 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  58.78 
 
 		 450 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  52.01 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
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NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  54.65 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
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NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  47.26 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  48.59 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  47.38 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  34.5 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  34.17 
 
 		 555 aa  229  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  31.19 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.78 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.05 
 
 		 365 aa  190  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.78 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.02 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  31.04 
 
 		 376 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.03 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.78 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  30.36 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  30.5 
 
 		 368 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  30.77 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.52 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  30.96 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.06 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.93 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.62 
 
 		 460 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  30.21 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.88 
 
 		 422 aa  117  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.83 
 
 		 413 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  28.47 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.64 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  29.27 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.2 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.72 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  28.1 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.96 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  28.1 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.77 
 
 		 419 aa  113  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.86 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.09 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.46 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.86 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  27.23 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.18 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.67 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  28.94 
 
 		 708 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  28.3 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 348 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.17 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  28.51 
 
 		 730 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  25.9 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  26.92 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.2 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.01 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.08 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.79 
 
 		 323 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.27 
 
 		 346 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  28.94 
 
 		 730 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.39 
 
 		 403 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.01 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.28 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.78 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  30.58 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.96 
 
 		 473 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.03 
 
 		 351 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  27.03 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.79 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.8 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.38 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  24.62 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.91 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  25.83 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.81 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.21 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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