225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3480 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  70.44 
 
 		 455 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  67.51 
 
 		 456 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  991    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  70.02 
 
 		 454 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  63.74 
 
 		 442 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  59.12 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  51.95 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  55.02 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  52.94 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  51.88 
 
 		 441 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  56.44 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  56.13 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  55.12 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  50.12 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  53.7 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  52.18 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  49.54 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  49.67 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
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NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  54.18 
 
 		 461 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  57.36 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  52.88 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  49.53 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  48.05 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  49.42 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  49.88 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  34.27 
 
 		 493 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  33.58 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  31.02 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.28 
 
 		 365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.05 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31 
 
 		 370 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  32.11 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  32.08 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
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NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.34 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.44 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.61 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  28.94 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  35.46 
 
 		 407 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.6 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.34 
 
 		 350 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  28.21 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.32 
 
 		 396 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.94 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.17 
 
 		 350 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.71 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  26.8 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.23 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.76 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.43 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  26.3 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  28.01 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  22.2 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.92 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.24 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.79 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  27.41 
 
 		 338 aa  100  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.77 
 
 		 427 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.78 
 
 		 440 aa  99.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  26.15 
 
 		 349 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  25.88 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  26.67 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.13 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  33.17 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.1 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.8 
 
 		 415 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.29 
 
 		 365 aa  98.2  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.52 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  27.56 
 
 		 375 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.64 
 
 		 393 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  28.75 
 
 		 366 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  24.29 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.12 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.39 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.62 
 
 		 340 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  28.4 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.95 
 
 		 372 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  25.14 
 
 		 730 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  31.49 
 
 		 368 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.11 
 
 		 342 aa  94.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  31.03 
 
 		 527 aa  94  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  24.16 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.37 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  28.19 
 
 		 340 aa  93.2  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.56 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  28.1 
 
 		 393 aa  93.2  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  29.88 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  25.25 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.23 
 
 		 437 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  25.82 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  29.81 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  23.91 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.48 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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