225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1721 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  70.44 
 
 		 484 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 455 aa  949    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  70.42 
 
 		 456 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  72.75 
 
 		 454 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  61.15 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  57.81 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  53.92 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  55.86 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  57.18 
 
 		 453 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  52.22 
 
 		 441 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  52.47 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  54.59 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  54.21 
 
 		 454 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  55.14 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  50 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  52.28 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  52.8 
 
 		 432 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  54.03 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  47.53 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  56.44 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  51.57 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  50.96 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  48.13 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  48.95 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  48.8 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  37.94 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  35.61 
 
 		 555 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  31.6 
 
 		 370 aa  196  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.12 
 
 		 370 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.37 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.17 
 
 		 365 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.52 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.67 
 
 		 365 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  30.62 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  30.77 
 
 		 368 aa  170  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.71 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  30.27 
 
 		 384 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  29.74 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.33 
 
 		 437 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  27.12 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.2 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  31.75 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.05 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  27.17 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.4 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  27.59 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.91 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.08 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.92 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.47 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  29.54 
 
 		 349 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.59 
 
 		 437 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.59 
 
 		 356 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.14 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.89 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.27 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  29.76 
 
 		 473 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  27.2 
 
 		 730 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.57 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.88 
 
 		 344 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  26.91 
 
 		 708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  31.5 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  29.37 
 
 		 473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  31.67 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.37 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.9 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.67 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  31.67 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  31.35 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  25.48 
 
 		 730 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.37 
 
 		 472 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.43 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.34 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  28.8 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.47 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.36 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  25.14 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.11 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  25.07 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.06 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  29.73 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  25.38 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.66 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.48 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.78 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.08 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  30.28 
 
 		 416 aa  107  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  30.47 
 
 		 366 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.48 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.93 
 
 		 351 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  25.85 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  31.08 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.524387 
 
 
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