225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3329 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  72.75 
 
 		 455 aa  716    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  71.2 
 
 		 456 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 454 aa  947    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  70.16 
 
 		 484 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  59.22 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  58.16 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  56.61 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  56.78 
 
 		 445 aa  554  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  56.68 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  58.31 
 
 		 453 aa  548  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  56.34 
 
 		 454 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  52.47 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  52.33 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  54.57 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  52.89 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  53.96 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  52.55 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  52.58 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  55.64 
 
 		 450 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  48.89 
 
 		 480 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  51.92 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  51.57 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  47.94 
 
 		 485 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  47.63 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  48.09 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  35.61 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  32.29 
 
 		 555 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.58 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  31 
 
 		 370 aa  193  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.81 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  29.86 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  30 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.42 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.04 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.27 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.04 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  33.01 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  28.75 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.82 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.98 
 
 		 350 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.63 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.33 
 
 		 362 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  25.86 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.11 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.04 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.47 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.21 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.17 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.47 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  30.71 
 
 		 338 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  28.96 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  27.74 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.11 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  27.72 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.39 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.4 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  24.29 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.43 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.81 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.88 
 
 		 351 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.14 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.4 
 
 		 356 aa  99.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  27.42 
 
 		 340 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.58 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.04 
 
 		 350 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.77 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.74 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  27.95 
 
 		 335 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.27 
 
 		 348 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.46 
 
 		 346 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2235  hypothetical protein  28.82 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.05 
 
 		 348 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  28.21 
 
 		 366 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  24.51 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.7 
 
 		 437 aa  96.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.27 
 
 		 342 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 360 aa  96.7  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.27 
 
 		 334 aa  96.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.27 
 
 		 334 aa  96.7  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  29.06 
 
 		 366 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.67 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002231  lysine 2,3-aminomutase  31.66 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.23 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.85 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.69 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.14 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  26.15 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  24.93 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.76 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  27.51 
 
 		 356 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.47 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  26.21 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  23.64 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  27.6 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.67 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.92 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  24.17 
 
 		 414 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.53 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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