225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2771 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  907    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
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NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  72.56 
 
 		 450 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  62.44 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  57.98 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  56.55 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  58.88 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  56.7 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
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NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  59.76 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  51.57 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  56.71 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  51.56 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
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NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  52.97 
 
 		 456 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  51.57 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  48.91 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  52.43 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  52.88 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  50.45 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
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NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  47.74 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  48.06 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
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NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  47.03 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
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NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  44.13 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  47.94 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  44.12 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  46.51 
 
 		 460 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  33.59 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  30.62 
 
 		 555 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  27.97 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.11 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.36 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.59 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.1 
 
 		 365 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.46 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.49 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  31.32 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  28.75 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  29.46 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  30.2 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  28.96 
 
 		 349 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.27 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.87 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  27.49 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.84 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.2 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  28 
 
 		 375 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.7 
 
 		 358 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.47 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  25.98 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  26.69 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.32 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.22 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  29.49 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.98 
 
 		 344 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.42 
 
 		 340 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  27.6 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.48 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.13 
 
 		 350 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.63 
 
 		 437 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.6 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  30.37 
 
 		 344 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.54 
 
 		 347 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  26.5 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.11 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.52 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.6 
 
 		 415 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  24.77 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  29.06 
 
 		 457 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.65 
 
 		 350 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.92 
 
 		 365 aa  93.2  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  24.12 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 		 437 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.79 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.51 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  28.28 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.56 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2339  Lysine 2,3-aminomutase  28.7 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000106877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.74 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.2 
 
 		 393 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 		 356 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0683  L-lysine 2,3-aminomutase  27.65 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.91 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.16 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  25.44 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5091  hypothetical protein  26.61 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5769  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.61 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.71 
 
 		 408 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.24 
 
 		 353 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.68 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  27.17 
 
 		 527 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.29 
 
 		 348 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.9 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.83 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.04 
 
 		 348 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.43 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2793  hypothetical protein  24.69 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00423361  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  33.16 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  23.38 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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