225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0857 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  75.79 
 
 		 453 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  71.56 
 
 		 432 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  76.18 
 
 		 461 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  915    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  73.55 
 
 		 454 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  60.38 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  55.74 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  53.24 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  55.14 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  56.87 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  55.4 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  54.59 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  53.43 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  55.12 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  53.61 
 
 		 454 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  51.65 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  51.57 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  58.88 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  58.57 
 
 		 450 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  49.31 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  51.98 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  54.42 
 
 		 441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  46.26 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  49.17 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  46.21 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  36.11 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  33.59 
 
 		 555 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  30 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.18 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.94 
 
 		 365 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.37 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.42 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.53 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  29.68 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.11 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  29.1 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  28.78 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  34.25 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  29.49 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.56 
 
 		 396 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  28.09 
 
 		 708 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  27.44 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  27.66 
 
 		 730 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.42 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.01 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.78 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.9 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  31.17 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.24 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.31 
 
 		 436 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  27.78 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.84 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.91 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.92 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.77 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.31 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  27.66 
 
 		 730 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.77 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  29.66 
 
 		 527 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.33 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.84 
 
 		 346 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.92 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.84 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.8 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  29.54 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  26.8 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  26.8 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.2 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.51 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  25.2 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.71 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  27.85 
 
 		 416 aa  94  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  27.35 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.58 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  26.78 
 
 		 338 aa  93.2  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.29 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.2 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5091  hypothetical protein  26.94 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.94 
 
 		 419 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5769  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.94 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.72 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.53 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  26.4 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  27.95 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  24.33 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  24.8 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  23.36 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  27.95 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04016  predicted lysine aminomutase  28.35 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03978  hypothetical protein  28.35 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.98 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.4 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  27.95 
 
 		 342 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4603  KamA family protein  27.17 
 
 		 342 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.639324  normal  0.81318 
 
 
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