225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0744 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  916    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  63.74 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  61.15 
 
 		 455 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  59.72 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  60.14 
 
 		 454 aa  564  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  56.5 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  55.56 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  50.58 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  55.06 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  53.81 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  50.95 
 
 		 441 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  55.4 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  55.64 
 
 		 454 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  49.54 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  50.34 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  49.76 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  50.49 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  51.2 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  52.88 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  52.43 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  53.77 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  50.46 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  52.9 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  48.7 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  50.12 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  33.5 
 
 		 555 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  33.01 
 
 		 493 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  32.43 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  28.99 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.85 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.17 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.35 
 
 		 365 aa  183  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.88 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.96 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  31.47 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  31.25 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  34.64 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.81 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.89 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.15 
 
 		 396 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.15 
 
 		 440 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_007984  BCI_0590  YodO family protein  24.85 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  27.4 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  30.3 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.27 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.21 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  28.57 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.51 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.15 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.26 
 
 		 411 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 360 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.8 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.76 
 
 		 345 aa  97.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.95 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 439 aa  96.3  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  28.85 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.42 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  29.11 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  26.78 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.79 
 
 		 344 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  28.4 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  25.55 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.69 
 
 		 393 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.57 
 
 		 334 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  27.57 
 
 		 334 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  27.57 
 
 		 342 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.45 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.51 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.71 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.46 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  26.36 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.46 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  28.24 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.35 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.65 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.52 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4676  KamA family protein  28.4 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  28.45 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5091  hypothetical protein  27.52 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5769  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.52 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.55 
 
 		 340 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.96 
 
 		 358 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  25.37 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  27.6 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5662  KamA family protein  28.4 
 
 		 342 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.122223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.74 
 
 		 348 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 347 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_010468  EcolC_3866  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.57 
 
 		 342 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.358809 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4388  KamA family protein  27.57 
 
 		 342 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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