225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2387 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  788    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.98 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.7 
 
 		 386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.1 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.1 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.44 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  52.38 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  52.21 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  49.03 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.61 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  42.59 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.87 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.39 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.81 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.3 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 439 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  36.07 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.29 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  37.25 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.1 
 
 		 423 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  36.07 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.84 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.83 
 
 		 427 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.74 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  36.36 
 
 		 415 aa  195  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.5 
 
 		 419 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  32.75 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
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NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.97 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.44 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  36.36 
 
 		 457 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  37.59 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.31 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  32.43 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  33.44 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  33.77 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.29 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  34.65 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.06 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.11 
 
 		 437 aa  186  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.53 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.74 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  33.33 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.78 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.78 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.81 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.33 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  33.22 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.96 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 468 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  36.31 
 
 		 435 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  39.41 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  32.63 
 
 		 480 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.49 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.41 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.77 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  38.3 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.99 
 
 		 437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  34.97 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.42 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.93 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  34.11 
 
 		 416 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.19 
 
 		 454 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.69 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  36.08 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  35.69 
 
 		 527 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.84 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  32.11 
 
 		 484 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.11 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  31.04 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.33 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  37.28 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.11 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  30.15 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  29.01 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  35.27 
 
 		 730 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.17 
 
 		 420 aa  175  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  36.01 
 
 		 708 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  29.92 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  36.08 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  32.79 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.84 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  34.25 
 
 		 730 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.9 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  32.24 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.96 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.11 
 
 		 411 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.21 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  38.57 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.44 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.99 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
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NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  27.36 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.23 
 
 		 422 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.57 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.79 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  35.78 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.09 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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