225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4495 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  71.16 
 
 
454 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  71.36 
 
 
453 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  896    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  71.56 
 
 
446 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  72.94 
 
 
461 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 
455 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  52.69 
 
 
456 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  52.72 
 
 
454 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  54.29 
 
 
468 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  56.7 
 
 
448 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  53.18 
 
 
441 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  53.7 
 
 
484 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  53.37 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  49.88 
 
 
448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  50.47 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  56.39 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  49.76 
 
 
433 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  49.65 
 
 
445 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  51.2 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  49.16 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  49.78 
 
 
480 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  52.42 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  46.82 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  49.05 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  46.67 
 
 
485 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  33.67 
 
 
555 aa  213  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  31.9 
 
 
493 aa  209  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.41 
 
 
365 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.08 
 
 
386 aa  190  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.9 
 
 
365 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  30.23 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.52 
 
 
370 aa  182  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.85 
 
 
379 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  29.92 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  31.7 
 
 
384 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.37 
 
 
392 aa  159  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  32.35 
 
 
407 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  29.01 
 
 
368 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.69 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.44 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.73 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.18 
 
 
393 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  30.04 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.4 
 
 
374 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.63 
 
 
415 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.63 
 
 
415 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  27.6 
 
 
349 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.58 
 
 
350 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 
419 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.97 
 
 
350 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  26.91 
 
 
416 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  26.39 
 
 
416 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25 
 
 
423 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3953  Lysine 2,3-aminomutase  28.25 
 
 
475 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.73 
 
 
350 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.33 
 
 
454 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.54 
 
 
427 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.21 
 
 
396 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  26.52 
 
 
420 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.93 
 
 
437 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.37 
 
 
356 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 
356 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  26.29 
 
 
338 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.39 
 
 
411 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30 
 
 
347 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.37 
 
 
440 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.53 
 
 
408 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.35 
 
 
460 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.72 
 
 
473 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.59 
 
 
356 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.3 
 
 
363 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.38 
 
 
403 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.22 
 
 
433 aa  99.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.22 
 
 
437 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  31.3 
 
 
527 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.21 
 
 
344 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  25.85 
 
 
347 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  27.48 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.41 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.18 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  25.45 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.44 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  25.1 
 
 
473 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  24.82 
 
 
483 aa  96.3  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  26.2 
 
 
730 aa  96.3  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  26.2 
 
 
708 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  27.04 
 
 
457 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.8 
 
 
337 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.1 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.65 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.51 
 
 
472 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.62 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>