225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0373 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 468 aa  961    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  60.98 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  55.38 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  59.13 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  57.81 
 
 		 455 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  59.12 
 
 		 484 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  55.79 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  59.62 
 
 		 453 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  59.04 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  58.55 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  55.29 
 
 		 434 aa  525  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  55.56 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  51.96 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  60.38 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  52.93 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  58.53 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  53.12 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  54.29 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  58.67 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  56.71 
 
 		 448 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  50.12 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  53.69 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  51.03 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  44.24 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  34.74 
 
 		 493 aa  245  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  34.05 
 
 		 555 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  32.11 
 
 		 376 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.33 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  28.64 
 
 		 370 aa  180  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.9 
 
 		 386 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.75 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  31.01 
 
 		 368 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.5 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.53 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.39 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  30.86 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  34.78 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.42 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  32.94 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.12 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.85 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.58 
 
 		 362 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.19 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.02 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.25 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.97 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  31.62 
 
 		 340 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.76 
 
 		 393 aa  103  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.09 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.19 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.34 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  29.63 
 
 		 340 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.11 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.68 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  28.3 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  32.3 
 
 		 527 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  31.06 
 
 		 366 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.84 
 
 		 351 aa  99.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.3 
 
 		 454 aa  99.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2532  L-lysine 2,3-aminomutase  29.61 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.82 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  30.45 
 
 		 483 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.04 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.47 
 
 		 363 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.63 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.25 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.39 
 
 		 356 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  28.09 
 
 		 416 aa  97.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.59 
 
 		 348 aa  97.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0464  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.47 
 
 		 348 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.681964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.13 
 
 		 381 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.5 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.74 
 
 		 358 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  26.81 
 
 		 473 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  25.16 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.09 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  24.77 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 		 342 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  28.02 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.38 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29 
 
 		 350 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.53 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.96 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.72 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4751  KamA family protein  26.42 
 
 		 342 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.691257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.36 
 
 		 403 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4611  KamA family protein  26.42 
 
 		 342 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4694  KamA family protein  26.42 
 
 		 342 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4730  KamA family protein  26.42 
 
 		 342 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>