225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8940 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  73.58 
 
 		 453 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  74.77 
 
 		 454 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 461 aa  941    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  72.77 
 
 		 432 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  75.41 
 
 		 446 aa  678    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  58.43 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  54.42 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  54.33 
 
 		 433 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  54.67 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  53.55 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  53.61 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  59.76 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  55.85 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  52.34 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  51.3 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  51.69 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  58.44 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  49.76 
 
 		 448 aa  481  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  52.94 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  53.63 
 
 		 484 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  52.58 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  54.39 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  47.92 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  48.8 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  49.74 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  34.74 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  33.42 
 
 		 555 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  30.15 
 
 		 370 aa  190  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.55 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.26 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.04 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.16 
 
 		 386 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  30.56 
 
 		 376 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.03 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.87 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  29.5 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  30.79 
 
 		 384 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  27.19 
 
 		 407 aa  147  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.47 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  29.71 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.33 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  29.25 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  29 
 
 		 375 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  28.41 
 
 		 416 aa  113  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.78 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  32.22 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.14 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  29.13 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.57 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  28 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.68 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.9 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.47 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.93 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.77 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  28.21 
 
 		 730 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.12 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.94 
 
 		 356 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  29.62 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.88 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.29 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.91 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.86 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.55 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.04 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.84 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.48 
 
 		 437 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  28.33 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  28.81 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.02 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  27.04 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  27.47 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.09 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.27 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.27 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  27.47 
 
 		 708 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  27.02 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  26.43 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.78 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.14 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.06 
 
 		 350 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.85 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.12 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  26.92 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.07 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  27.42 
 
 		 366 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.41 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  28.21 
 
 		 344 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.19 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.27 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.99 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.27 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  25 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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