144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0250 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  100 
 
 		 524 aa  1083    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  62.48 
 
 		 523 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  70.82 
 
 		 522 aa  758    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  61.12 
 
 		 526 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  52.75 
 
 		 532 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  55.01 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  56.35 
 
 		 520 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  51.61 
 
 		 526 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  55.85 
 
 		 519 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  52.61 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  52.8 
 
 		 527 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  52.8 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  55.23 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  53.81 
 
 		 520 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  54.02 
 
 		 517 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  54.29 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  53.67 
 
 		 539 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  53.94 
 
 		 483 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  49.72 
 
 		 539 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  50.29 
 
 		 516 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  51.14 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  51.28 
 
 		 567 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  51.43 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  52.77 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  51.04 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  52.05 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  48.94 
 
 		 514 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  46.54 
 
 		 547 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  42.96 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  43.86 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  43.35 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  28.15 
 
 		 727 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  45.58 
 
 		 191 aa  143  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.67 
 
 		 555 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  27.31 
 
 		 529 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  28.06 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.88 
 
 		 555 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 535 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  27.52 
 
 		 534 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  27.12 
 
 		 563 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.67 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  28.1 
 
 		 531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.3 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  28.23 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.88 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  27.95 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  26.03 
 
 		 545 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.65 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  27.19 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.82 
 
 		 564 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.94 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.34 
 
 		 541 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  27.07 
 
 		 528 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  26.52 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.88 
 
 		 511 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  28.65 
 
 		 600 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  27.46 
 
 		 520 aa  100  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.13 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  25.33 
 
 		 521 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  26.96 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  24.7 
 
 		 573 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  24.61 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.98 
 
 		 524 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  25.73 
 
 		 516 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  25.31 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  27.98 
 
 		 532 aa  97.8  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  25.27 
 
 		 540 aa  97.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  25.42 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  27.18 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  27.43 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  25.06 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  27.58 
 
 		 549 aa  93.6  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  26.41 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  23.82 
 
 		 679 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  26.09 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  26.14 
 
 		 617 aa  91.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  25.79 
 
 		 523 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  26.06 
 
 		 525 aa  91.3  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  24.38 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  26.07 
 
 		 529 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  25.91 
 
 		 523 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  25.78 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  26.04 
 
 		 710 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.36 
 
 		 540 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  25.51 
 
 		 583 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  25.31 
 
 		 576 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  26.14 
 
 		 588 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  26.32 
 
 		 554 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  25.64 
 
 		 557 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  25.93 
 
 		 534 aa  87.4  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  24.83 
 
 		 528 aa  87  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  24.47 
 
 		 538 aa  86.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  27.51 
 
 		 596 aa  86.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  26.02 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  26.35 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  25.89 
 
 		 588 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  25.58 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  25.77 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  26.07 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>