45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_52320  integrase  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  56.94 
 
 		 288 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  48.25 
 
 		 287 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  45.45 
 
 		 305 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  40.89 
 
 		 300 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  40.69 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  34.92 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  34.92 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  28.99 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  31.46 
 
 		 487 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  31.09 
 
 		 487 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  30.74 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  32.44 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  32.44 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  35.67 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.25 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  27.66 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  30.93 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  29.77 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1014  hypothetical protein  24.87 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  28.68 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  27.48 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1049  hypothetical protein  25.54 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  30.52 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  28.21 
 
 		 534 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  23.84 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1074  hypothetical protein  25.26 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  26.62 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  24.47 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  41.18 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 400 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  45.71 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  22.61 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  27.42 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.41 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  32.56 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  35.14 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  41.79 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  27.18 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5433  hypothetical protein  39.68 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.802569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>