43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7082 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  297  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  35.25 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  32.68 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  30.66 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  34.17 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  32.87 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  27.92 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  33.56 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  33.79 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  26.71 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  27.27 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  28.85 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  30.34 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  25.64 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  28.67 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  28.67 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  36.43 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  31.97 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  36.43 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  24.36 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  31.47 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  32.26 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  36.43 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  24.66 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.39 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  26.71 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  25.64 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  24.1 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  28.78 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  23.74 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  22.08 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  28.46 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  28.46 
 
 		 259 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  29.66 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  28.67 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  35.42 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>