More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3128 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  100 
 
 		 367 aa  741    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  67.05 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  70.23 
 
 		 352 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  65.09 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  65.06 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  62.28 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  62.28 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  56.93 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  51.29 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  51.74 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  50.86 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  47.56 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  50.57 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  48.12 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  48.04 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  50.86 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  50.29 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.25 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  40.6 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.6 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.08 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.85 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.64 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.26 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.18 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  29.06 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  29.06 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  32.78 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.96 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.52 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.92 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  30.13 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.21 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  38.32 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  28.78 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.11 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  32.41 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  29.56 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.98 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.37 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>