More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2792 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  283  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  64.55 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  64.49 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  57.94 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  62.04 
 
 		 170 aa  137  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  57.02 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  58.56 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  62.26 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  55.56 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  53.27 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  49.53 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  52.38 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  48.67 
 
 		 168 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  44.36 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  50.45 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.79 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.79 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03748  transcriptional regulatory protein  50.48 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  46.73 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  46.08 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  46.08 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  46.08 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  46.08 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  38.06 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  46.08 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  46.08 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  50.48 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  41.07 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  41.07 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  41.53 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  41.82 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  40.74 
 
 		 272 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  37.82 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  37.29 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  42.45 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  41.53 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>