74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3945 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  893    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  60.47 
 
 
431 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  26.41 
 
 
523 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  25.96 
 
 
503 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  24.85 
 
 
656 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.21 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.21 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  25.1 
 
 
551 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  25.1 
 
 
538 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  25.6 
 
 
510 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  25.25 
 
 
529 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  26.41 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  24.65 
 
 
510 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.31 
 
 
509 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  23.93 
 
 
558 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  23.09 
 
 
546 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  23.23 
 
 
564 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  21.46 
 
 
533 aa  99.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  24.5 
 
 
540 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  23.23 
 
 
532 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  22.94 
 
 
531 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  29.32 
 
 
559 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  23.14 
 
 
531 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  25.75 
 
 
547 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  29.79 
 
 
536 aa  79.7  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  24.28 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  20.2 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  34.17 
 
 
242 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  26.26 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.15 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  23.77 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.65 
 
 
244 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  29.48 
 
 
259 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  26.29 
 
 
602 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  27.75 
 
 
526 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.42 
 
 
221 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  31.25 
 
 
248 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  29.75 
 
 
513 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  27.54 
 
 
246 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  29.75 
 
 
513 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  27.08 
 
 
514 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  28.48 
 
 
491 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  30.21 
 
 
214 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.97 
 
 
251 aa  53.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.14 
 
 
253 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  29.77 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  29.77 
 
 
520 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  29.77 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  29.77 
 
 
513 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  29.77 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  29.77 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  29.77 
 
 
513 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  21.67 
 
 
502 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.53 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.57 
 
 
259 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  23.88 
 
 
202 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  23.35 
 
 
225 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  25.16 
 
 
242 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.52 
 
 
257 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.85 
 
 
371 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  27.17 
 
 
235 aa  46.6  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  31.46 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  23.5 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  24.83 
 
 
250 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  24.48 
 
 
252 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.87 
 
 
246 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  25.47 
 
 
256 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  25.68 
 
 
252 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  24.82 
 
 
251 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  25.84 
 
 
237 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  25.15 
 
 
253 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  26.53 
 
 
3021 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  26.51 
 
 
254 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>