More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2137 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  62.26 
 
 
544 aa  648    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  61.16 
 
 
544 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  64.08 
 
 
544 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  63.31 
 
 
545 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
544 aa  686    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  64.96 
 
 
539 aa  684    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  62.99 
 
 
545 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  63.21 
 
 
542 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.8 
 
 
545 aa  634    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  67.29 
 
 
540 aa  705    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  71.08 
 
 
544 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  71.27 
 
 
544 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  71.27 
 
 
544 aa  738    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  65.53 
 
 
541 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.16 
 
 
537 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
543 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
542 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  64.84 
 
 
545 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
548 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  60.97 
 
 
545 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
544 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
560 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  61.35 
 
 
554 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  62.41 
 
 
547 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  63.23 
 
 
576 aa  668    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  62.88 
 
 
547 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
544 aa  653    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  70.47 
 
 
542 aa  741    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
544 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
546 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
548 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  71.08 
 
 
544 aa  736    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
545 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
555 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  63.21 
 
 
544 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  80.8 
 
 
541 aa  850    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  61.5 
 
 
543 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  61.75 
 
 
548 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  69.85 
 
 
539 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  68.44 
 
 
536 aa  722    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
548 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  65.79 
 
 
547 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
541 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  65.6 
 
 
540 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  63.81 
 
 
550 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  61.58 
 
 
546 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  60.68 
 
 
552 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  60.85 
 
 
545 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.5 
 
 
544 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
550 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  61.62 
 
 
540 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  61.62 
 
 
540 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
541 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
550 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
546 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  64.34 
 
 
553 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  63.82 
 
 
545 aa  676    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
547 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  62.41 
 
 
539 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  66.16 
 
 
541 aa  691    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  66.16 
 
 
541 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  67.04 
 
 
540 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  63.77 
 
 
544 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.15 
 
 
542 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.57 
 
 
542 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  72.62 
 
 
539 aa  754    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  73 
 
 
539 aa  756    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
561 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
544 aa  661    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  68.76 
 
 
546 aa  723    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
551 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
540 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  66.09 
 
 
542 aa  675    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  64.66 
 
 
541 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  65.43 
 
 
543 aa  701    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  66.85 
 
 
539 aa  711    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
539 aa  687    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  64.1 
 
 
545 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
543 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  62.22 
 
 
547 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  65.34 
 
 
543 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  63.37 
 
 
542 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
539 aa  694    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
541 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  60.97 
 
 
544 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.95 
 
 
554 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.59 
 
 
547 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  61.3 
 
 
545 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  61.3 
 
 
545 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
541 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  64.74 
 
 
541 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  66.16 
 
 
541 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  65.42 
 
 
541 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  64.03 
 
 
547 aa  676    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0945  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
545 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0596122  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  60.63 
 
 
549 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0699  chaperonin GroEL  62.76 
 
 
546 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.0116796 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  64.91 
 
 
544 aa  660    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2567  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
552 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164094  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.8 
 
 
545 aa  634    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>