More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1944 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1944  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  956    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2634  Aldehyde Dehydrogenase  50.85 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4998  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.07 
 
 		 482 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.07 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.86 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.86 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.61 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.03 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.68 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.03 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  43.86 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  43.86 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.51 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.86 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  45.99 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.17 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.4 
 
 		 482 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.58 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  43.5 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.44 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.82 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 		 500 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.61 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.17 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.43 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.41 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.82 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.67 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  46.19 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.82 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  45.2 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.95 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.48 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.59 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.88 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.67 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.88 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.76 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  44.28 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.61 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  44.47 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4665  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.59 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.67 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.57 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.46 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2023  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.491893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.67 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.67 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.46 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  44.8 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.67 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.07 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.56 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.23 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.83 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  47.13 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.03 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.13 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.64 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.51 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.55 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0465  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.73 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>