More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1239 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1239  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
327 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.289253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4194  glycosyl transferase family 2  43.73 
 
 
362 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
824 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3009  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0884147  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 
957 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.56 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
321 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
1250 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.29 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.5 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
623 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
613 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
613 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
613 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
1032 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  27.64 
 
 
613 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.79 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 
613 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.79 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  24.61 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.3 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
727 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  26.26 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 
613 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.14 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.97 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.04 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
1035 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
1562 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  29.59 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.41 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
812 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
777 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1482  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8598  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.740895  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>