More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0351 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
328 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  64.63 
 
 
324 aa  349  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  52.2 
 
 
330 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  47.78 
 
 
317 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  44.04 
 
 
334 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 
318 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  47.33 
 
 
358 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  48.72 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  46.48 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  47.42 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  52.63 
 
 
410 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  30.52 
 
 
356 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  30.07 
 
 
352 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
358 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.95 
 
 
371 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.95 
 
 
371 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.95 
 
 
371 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.55 
 
 
371 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  30.95 
 
 
371 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  30.95 
 
 
371 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  29.72 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  31.91 
 
 
381 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  31.05 
 
 
347 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.91 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
362 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 
369 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  28.38 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.94 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  29.24 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  33 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  43.23 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  31.85 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  31.33 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  31.33 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.94 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.94 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.94 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.73 
 
 
516 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.22 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  26.2 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.62 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  25.26 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.55 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.31 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.03 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.26 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1781  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.29 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
402 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.66 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  31.71 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.51 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.41 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  33.76 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.73 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
408 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  38.24 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  38.24 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.62 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  38.24 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  38.24 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  38.24 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.73 
 
 
394 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2881  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  26.35 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  22.68 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  32.5 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  32.5 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.73 
 
 
390 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  38.24 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  38.24 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.73 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.82 
 
 
348 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  30.82 
 
 
348 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.73 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.82 
 
 
348 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.73 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>