131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0035 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0035  glucarate dehydratase  100 
 
 		 186 aa  386  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  90.12 
 
 		 442 aa  313  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2393  glucarate dehydratase  81.7 
 
 		 444 aa  278  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.617772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2497  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  77.78 
 
 		 441 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6488  (D)-glucarate dehydratase 1  74.51 
 
 		 451 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6530  glucarate dehydratase  73.86 
 
 		 449 aa  254  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124321  normal  0.118965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3182  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.475312  normal  0.651115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3166  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3280  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3119  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3101  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0901  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  253  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3091  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  253  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00700735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0925  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  253  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4047  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  253  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02632  (D)-glucarate dehydratase 1  72.08 
 
 		 446 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02594  hypothetical protein  72.08 
 
 		 446 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2931  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2925  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4102  glucarate dehydratase  73.2 
 
 		 449 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3623  glucarate dehydratase  71.9 
 
 		 451 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3086  glucarate dehydratase  71.43 
 
 		 446 aa  249  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3721  D-glucarate dehydratase  70.37 
 
 		 447 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3240  D-glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2142  glucarate dehydratase  69.93 
 
 		 450 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1990  glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 445 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0970  D-glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 450 aa  248  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.886707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1790  Glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 445 aa  247  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3120  glucarate dehydratase  69.75 
 
 		 450 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3715  D-glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 456 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0539  glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 449 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0843  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  245  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1216  D-glucarate dehydratase  71.9 
 
 		 449 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529304  normal  0.0486159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0248  glucarate dehydratase  70.59 
 
 		 445 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0809  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1731  glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 451 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00228751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3395  glucarate dehydratase  72.73 
 
 		 446 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0834  D-glucarate dehydratase  69.93 
 
 		 451 aa  244  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608839  normal  0.0271686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4631  glucarate dehydratase  71.9 
 
 		 451 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139469  hitchhiker  0.000950159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3555  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 446 aa  244  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4275  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  69.28 
 
 		 450 aa  244  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0189  glucarate dehydratase  71.9 
 
 		 457 aa  244  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1041  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  69.28 
 
 		 450 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0684  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  69.28 
 
 		 450 aa  243  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1163  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  69.28 
 
 		 450 aa  243  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1139  glucarate dehydratase  69.28 
 
 		 450 aa  243  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4757  glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 448 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00282791  hitchhiker  0.00286979 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1045  glucarate dehydratase  68.63 
 
 		 450 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4766  glucarate dehydratase  71.24 
 
 		 451 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1079  glucarate dehydratase protein  72.55 
 
 		 453 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5152  glucarate dehydratase  70.59 
 
 		 461 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0663  glucarate dehydratase  69.93 
 
 		 451 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1118  glucarate dehydratase  69.93 
 
 		 444 aa  240  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0946  glucarate dehydratase  70.59 
 
 		 456 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189357  normal  0.0818467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1011  glucarate dehydratase  70.59 
 
 		 456 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3285  glucarate dehydratase  68.52 
 
 		 450 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3421  D-glucarate dehydratase  69.28 
 
 		 444 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7096  glucarate dehydratase  69.28 
 
 		 450 aa  235  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1017  glucarate dehydratase  70.59 
 
 		 445 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0552689  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1130  glucarate dehydratase  67.32 
 
 		 444 aa  233  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6204  glucarate dehydratase  67.32 
 
 		 451 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4449  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.83 
 
 		 469 aa  230  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4583  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.83 
 
 		 469 aa  230  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3396  Glucarate dehydratase  69.28 
 
 		 450 aa  228  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0829  glucarate dehydratase protein  68.42 
 
 		 445 aa  228  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3556  Glucarate dehydratase  68.63 
 
 		 450 aa  227  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0842  Glucarate dehydratase  67.97 
 
 		 453 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0201  glucarate dehydratase  66.23 
 
 		 465 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203534  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0808  Glucarate dehydratase  67.97 
 
 		 461 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1214  D-glucarate dehydratase  65.58 
 
 		 464 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0710823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3396  glucarate dehydratase  67.53 
 
 		 465 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0216  glucarate dehydratase  67.53 
 
 		 465 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2811  glucarate dehydratase  67.53 
 
 		 465 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0295  glucarate dehydratase  67.53 
 
 		 465 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3092  glucarate dehydratase  66.88 
 
 		 446 aa  218  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.026036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0224  glucarate dehydratase  66.88 
 
 		 465 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3241  D-glucarate dehydratase  67.53 
 
 		 447 aa  218  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2481  glucarate dehydratase  62.09 
 
 		 441 aa  217  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0276  glucarate dehydratase  66.23 
 
 		 465 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3183  glucarate dehydratase  66.88 
 
 		 446 aa  215  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.558486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02633  predicted glucarate dehydratase  66.23 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0900  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.23 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02595  hypothetical protein  66.23 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2932  glucarate dehydratase  66.23 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0924  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.23 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2926  glucarate dehydratase  66.23 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3167  glucarate dehydratase  66.88 
 
 		 446 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.153553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3102  glucarate dehydratase  66.88 
 
 		 446 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3120  glucarate dehydratase  66.88 
 
 		 446 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0446  Glucarate dehydratase  70.63 
 
 		 432 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0188  hypothetical protein  60.16 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.97 
 
 		 429 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.66 
 
 		 434 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4200  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.12 
 
 		 421 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.33 
 
 		 435 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18905  decreased coverage  0.00252858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.69 
 
 		 422 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0754  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.48 
 
 		 421 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1083  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.51 
 
 		 419 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00426043  hitchhiker  0.00242262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1029  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.1 
 
 		 419 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.07 
 
 		 433 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>