190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2925 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02632  (D)-glucarate dehydratase 1  98.65 
 
 		 446 aa  920    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0901  glucarate dehydratase  99.1 
 
 		 446 aa  923    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4757  glucarate dehydratase  72.79 
 
 		 448 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00282791  hitchhiker  0.00286979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1079  glucarate dehydratase protein  72.05 
 
 		 453 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3285  glucarate dehydratase  73.92 
 
 		 450 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3120  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 450 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3715  D-glucarate dehydratase  73.92 
 
 		 456 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3119  glucarate dehydratase  96.64 
 
 		 446 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3182  glucarate dehydratase  96.86 
 
 		 446 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.475312  normal  0.651115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3721  D-glucarate dehydratase  76.87 
 
 		 447 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4275  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  72.58 
 
 		 450 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0189  glucarate dehydratase  72.97 
 
 		 457 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6530  glucarate dehydratase  75.73 
 
 		 449 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124321  normal  0.118965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3101  glucarate dehydratase  96.86 
 
 		 446 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3421  D-glucarate dehydratase  73.02 
 
 		 444 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3280  glucarate dehydratase  96.86 
 
 		 446 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3086  glucarate dehydratase  98.21 
 
 		 446 aa  915    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0539  glucarate dehydratase  74.16 
 
 		 449 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0946  glucarate dehydratase  73.42 
 
 		 456 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189357  normal  0.0818467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0834  D-glucarate dehydratase  73.47 
 
 		 451 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608839  normal  0.0271686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1011  glucarate dehydratase  73.92 
 
 		 456 aa  690    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4047  glucarate dehydratase  99.1 
 
 		 446 aa  923    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0843  glucarate dehydratase  84.98 
 
 		 446 aa  816    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0684  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  72.58 
 
 		 450 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.82 
 
 		 442 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3166  glucarate dehydratase  96.86 
 
 		 446 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7096  glucarate dehydratase  70.91 
 
 		 450 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1041  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  72.81 
 
 		 450 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1045  glucarate dehydratase  73.03 
 
 		 450 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3555  glucarate dehydratase  84.75 
 
 		 446 aa  809    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1790  Glucarate dehydratase  70.43 
 
 		 445 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1163  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  72.58 
 
 		 450 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4102  glucarate dehydratase  75.51 
 
 		 449 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1017  glucarate dehydratase  68.62 
 
 		 445 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0552689  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2393  glucarate dehydratase  70.23 
 
 		 444 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.617772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3623  glucarate dehydratase  71.43 
 
 		 451 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1130  glucarate dehydratase  72.79 
 
 		 444 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1990  glucarate dehydratase  70.2 
 
 		 445 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0970  D-glucarate dehydratase  72.32 
 
 		 450 aa  685    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.886707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0809  glucarate dehydratase  85.2 
 
 		 446 aa  816    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02594  hypothetical protein  98.65 
 
 		 446 aa  920    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3240  D-glucarate dehydratase  92.83 
 
 		 446 aa  874    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1216  D-glucarate dehydratase  72 
 
 		 449 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529304  normal  0.0486159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6488  (D)-glucarate dehydratase 1  72.21 
 
 		 451 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4631  glucarate dehydratase  71.88 
 
 		 451 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139469  hitchhiker  0.000950159 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3395  glucarate dehydratase  84.75 
 
 		 446 aa  810    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1731  glucarate dehydratase  74.49 
 
 		 451 aa  698    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00228751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2931  glucarate dehydratase  98.65 
 
 		 446 aa  920    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3091  glucarate dehydratase  98.88 
 
 		 446 aa  921    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00700735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0248  glucarate dehydratase  70.27 
 
 		 445 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2142  glucarate dehydratase  74.55 
 
 		 450 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4766  glucarate dehydratase  72.79 
 
 		 451 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0925  glucarate dehydratase  98.88 
 
 		 446 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2925  glucarate dehydratase  100 
 
 		 446 aa  929    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0663  glucarate dehydratase  73.7 
 
 		 451 aa  700    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5152  glucarate dehydratase  70.91 
 
 		 461 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1139  glucarate dehydratase  72.58 
 
 		 450 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6204  glucarate dehydratase  72.05 
 
 		 451 aa  663    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1118  glucarate dehydratase  72.83 
 
 		 444 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0842  Glucarate dehydratase  64.73 
 
 		 453 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2497  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.1 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4449  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.08 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1214  D-glucarate dehydratase  62.47 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0710823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4583  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.08 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3183  glucarate dehydratase  64.96 
 
 		 446 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.558486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3241  D-glucarate dehydratase  65.4 
 
 		 447 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0446  Glucarate dehydratase  66.9 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3167  glucarate dehydratase  64.73 
 
 		 446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.153553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0808  Glucarate dehydratase  64.51 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3120  glucarate dehydratase  64.51 
 
 		 446 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3102  glucarate dehydratase  64.29 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3092  glucarate dehydratase  63.39 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.026036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02633  predicted glucarate dehydratase  63.17 
 
 		 446 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0900  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.95 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02595  hypothetical protein  63.17 
 
 		 446 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3556  Glucarate dehydratase  62.91 
 
 		 450 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2932  glucarate dehydratase  63.17 
 
 		 446 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3396  Glucarate dehydratase  62.91 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0924  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.95 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2926  glucarate dehydratase  62.72 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0276  glucarate dehydratase  62.69 
 
 		 465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815006 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2811  glucarate dehydratase  63.12 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0295  glucarate dehydratase  63.12 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0829  glucarate dehydratase protein  64.64 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0216  glucarate dehydratase  62.99 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0224  glucarate dehydratase  62.99 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0201  glucarate dehydratase  62.8 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203534  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3396  glucarate dehydratase  62.55 
 
 		 465 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2481  glucarate dehydratase  59.55 
 
 		 441 aa  548  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.55 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.01 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0035  glucarate dehydratase  72.08 
 
 		 186 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2911  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.1 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.29 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18905  decreased coverage  0.00252858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2716  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.49 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734376  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.32 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3283  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.57 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.56 
 
 		 422 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6284  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.32 
 
 		 424 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1083  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.25 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00426043  hitchhiker  0.00242262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>