239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0344 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  669    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  54.3 
 
 
335 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  52.2 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  50.42 
 
 
380 aa  316  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  44.15 
 
 
335 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  36.22 
 
 
328 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  34.1 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  33.63 
 
 
372 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  35.93 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  36.75 
 
 
341 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  38.35 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  34.29 
 
 
284 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  34 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  35.21 
 
 
313 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  35.71 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  35.59 
 
 
316 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
573 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  35.23 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  34.21 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  35.14 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  34.17 
 
 
310 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  35.36 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  34.18 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  34.97 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  34.88 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  35.19 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  34.88 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  34.88 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  32.59 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  34.23 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  34.52 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  33.72 
 
 
318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  27.64 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  27.64 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  26.81 
 
 
355 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  31.6 
 
 
330 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  33.67 
 
 
310 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  28.62 
 
 
348 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  31.66 
 
 
311 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  26.09 
 
 
339 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.81 
 
 
324 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.51 
 
 
355 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  25.42 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  32.32 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  27.37 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  26.17 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  32.89 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  29.07 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  26.71 
 
 
352 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  27.43 
 
 
352 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  26.71 
 
 
340 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  26.41 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  26.41 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  27.14 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  24.93 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  30.4 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  26.85 
 
 
357 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  25.82 
 
 
340 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  29.12 
 
 
304 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  26.69 
 
 
340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.39 
 
 
377 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.92 
 
 
340 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  26.35 
 
 
352 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  28.62 
 
 
328 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  28.92 
 
 
331 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.46 
 
 
349 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  31.7 
 
 
328 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  25.36 
 
 
355 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  26.63 
 
 
359 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  31.67 
 
 
328 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  26.52 
 
 
349 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  29.22 
 
 
341 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  26.22 
 
 
349 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  26.22 
 
 
349 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  26.22 
 
 
349 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  26.22 
 
 
349 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30 
 
 
337 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  26.99 
 
 
360 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  28.44 
 
 
326 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  26.19 
 
 
348 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  26.8 
 
 
361 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  27.11 
 
 
352 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  32.61 
 
 
310 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  26.69 
 
 
340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  29.32 
 
 
341 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  26.07 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  26.96 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  30.8 
 
 
352 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  26.65 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  28.77 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  25.46 
 
 
356 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  24.25 
 
 
363 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>