More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0332 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 
300 aa  305  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 
296 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
298 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
297 aa  275  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 
301 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
301 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 
301 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 
302 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 
302 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  47.08 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.78 
 
 
300 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  46.76 
 
 
297 aa  265  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 
300 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
298 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 
303 aa  264  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
299 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  46.1 
 
 
303 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 
298 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  46.08 
 
 
293 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 
303 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  46.94 
 
 
305 aa  256  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 
297 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
299 aa  251  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 
303 aa  249  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 
299 aa  248  6e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
303 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
314 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
296 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
314 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
298 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 
297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
298 aa  234  9e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  44.68 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 
301 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
306 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 
313 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 
310 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
308 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 
451 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 
301 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 
318 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
313 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
307 aa  226  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  42.36 
 
 
300 aa  225  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  39.25 
 
 
324 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 
449 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  40.41 
 
 
301 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 
311 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 
300 aa  223  3e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 
322 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  39.8 
 
 
294 aa  222  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
295 aa  222  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 
296 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  38.8 
 
 
310 aa  222  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 
306 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 
299 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  38.83 
 
 
489 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 
315 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 
293 aa  218  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 
303 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 
303 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 
312 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  39.02 
 
 
306 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 
468 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 
299 aa  217  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  38.26 
 
 
314 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 
315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 
337 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  39.2 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>