More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0245 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  72.44 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  58.54 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  58.77 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  57.89 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  57.89 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.84 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  53.12 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  56.3 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.97 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  46.83 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  46.03 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  51.59 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  44.88 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  48.41 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  52.99 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  46.46 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  44.44 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  46.83 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  50.82 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  51.64 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  46.34 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  46.34 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  48.39 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  50.39 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  50.42 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  43.65 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  46.67 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  46.4 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>