More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5977 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.69 
 
 		 753 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  49 
 
 		 737 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.83 
 
 		 723 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.23 
 
 		 750 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.5 
 
 		 781 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.58 
 
 		 758 aa  660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 733 aa  1464    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.8 
 
 		 752 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.24 
 
 		 725 aa  791    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.87 
 
 		 733 aa  816    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.57 
 
 		 747 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51 
 
 		 757 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.13 
 
 		 718 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.16 
 
 		 748 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  55.03 
 
 		 739 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.44 
 
 		 722 aa  906    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.08 
 
 		 733 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.09 
 
 		 760 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.74 
 
 		 741 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.44 
 
 		 733 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.68 
 
 		 736 aa  788    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.26 
 
 		 749 aa  698    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.74 
 
 		 741 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.3 
 
 		 747 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.13 
 
 		 756 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.19 
 
 		 741 aa  670    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.71 
 
 		 750 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.74 
 
 		 741 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.63 
 
 		 752 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.48 
 
 		 746 aa  783    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.02 
 
 		 726 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.8 
 
 		 759 aa  601  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.67 
 
 		 778 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  47.45 
 
 		 741 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.67 
 
 		 730 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  43.17 
 
 		 739 aa  495  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 786 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 		 819 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 		 819 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.78 
 
 		 818 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.81 
 
 		 704 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.2 
 
 		 815 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  38.05 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.26 
 
 		 720 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 		 842 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.55 
 
 		 703 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 		 817 aa  442  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.02 
 
 		 765 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.22 
 
 		 706 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 702 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.82 
 
 		 695 aa  436  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 712 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 		 707 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.29 
 
 		 832 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.83 
 
 		 827 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.6 
 
 		 706 aa  435  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.63 
 
 		 827 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.28 
 
 		 703 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.89 
 
 		 706 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.55 
 
 		 822 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.48 
 
 		 779 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.87 
 
 		 767 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  36.19 
 
 		 818 aa  429  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.62 
 
 		 842 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 		 691 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.02 
 
 		 740 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.18 
 
 		 689 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.4 
 
 		 818 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.83 
 
 		 822 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.63 
 
 		 846 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  35.47 
 
 		 792 aa  417  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.19 
 
 		 685 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.39 
 
 		 696 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.57 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.9 
 
 		 778 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.42 
 
 		 818 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.49 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 		 728 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.97 
 
 		 706 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.9 
 
 		 719 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.91 
 
 		 829 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.9 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.47 
 
 		 686 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 		 785 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.34 
 
 		 772 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.03 
 
 		 714 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 698 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.71 
 
 		 704 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.76 
 
 		 717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.94 
 
 		 707 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.69 
 
 		 701 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 		 737 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.87 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.83 
 
 		 683 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.36 
 
 		 703 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.22 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 678 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.23 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.48 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>