More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5908 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  73.51 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  270  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  67.03 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  267  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  67.03 
 
 		 185 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  258  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  257  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  253  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  247  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  246  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  62.5 
 
 		 186 aa  245  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  67.03 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  243  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  243  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 188 aa  198  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.21 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 190 aa  184  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 192 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.16 
 
 		 186 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  45.76 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  46.59 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 174 aa  174  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>