More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5147 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  58.21 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  55.47 
 
 		 139 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  57.78 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  52.59 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  50.36 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  51.82 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  52.55 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  47.41 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  47.45 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  40.32 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  38.64 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  38.84 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  40.83 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  40.83 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  39.66 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.28 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.16 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35.11 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.47 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  30.66 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.93 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  37.1 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3154  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  36.36 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  39.81 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.07 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  34.71 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.7 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  39.67 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  36.64 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 624 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  35.59 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.54 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  35.88 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  33.88 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.16 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  28.81 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  34.48 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  30.15 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  33.96 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.33 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  37.61 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  32.56 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  29.23 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  28 
 
 		 903 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  32.5 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  38.32 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.88 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 885 aa  60.1  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>