More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4853 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  43.69 
 
 		 1577 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.97 
 
 		 1832 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 		 2232 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  46.15 
 
 		 2162 aa  715    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  35.19 
 
 		 1823 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  100 
 
 		 1819 aa  3482    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 2333 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 		 1656 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  45.61 
 
 		 2111 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.75 
 
 		 3508 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  47.63 
 
 		 1580 aa  710    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.93 
 
 		 2085 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  44.43 
 
 		 1704 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 		 2230 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  42.48 
 
 		 1827 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.25 
 
 		 1939 aa  777    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  44.76 
 
 		 1263 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  41.65 
 
 		 1876 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.94 
 
 		 1804 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  47.63 
 
 		 1580 aa  710    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.93 
 
 		 2085 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  44.43 
 
 		 1704 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  41.65 
 
 		 2220 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.66 
 
 		 3449 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  44.63 
 
 		 1805 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  44.01 
 
 		 1581 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  43.11 
 
 		 1828 aa  698    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 1698 aa  697    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  47.42 
 
 		 1580 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.98 
 
 		 2085 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  44.39 
 
 		 1704 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.15 
 
 		 4183 aa  635  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  39.37 
 
 		 2108 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.33 
 
 		 2225 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  47.22 
 
 		 1520 aa  626  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  47.53 
 
 		 1190 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  47.22 
 
 		 1520 aa  626  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  47.53 
 
 		 1190 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 		 1835 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  47.41 
 
 		 1190 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  39.7 
 
 		 2126 aa  620  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  44.1 
 
 		 1744 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  38.66 
 
 		 3930 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 		 7210 aa  609  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 		 1587 aa  608  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  46.76 
 
 		 1822 aa  610  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 		 1812 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  40.07 
 
 		 2111 aa  609  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  42.29 
 
 		 2966 aa  609  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  42.98 
 
 		 3696 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  40.82 
 
 		 2020 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  37.42 
 
 		 2762 aa  603  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.73 
 
 		 1144 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 		 1704 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.29 
 
 		 1087 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.24 
 
 		 2890 aa  596  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 7110 aa  595  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.33 
 
 		 1822 aa  596  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  39.24 
 
 		 2846 aa  593  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  39.04 
 
 		 2101 aa  592  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.61 
 
 		 2136 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.28 
 
 		 4478 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  40.2 
 
 		 2188 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 2551 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 1874 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  42.16 
 
 		 1076 aa  589  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  36.07 
 
 		 3408 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 		 7279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  43.06 
 
 		 2090 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  41.99 
 
 		 4607 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  33.46 
 
 		 3711 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 3676 aa  583  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  32.22 
 
 		 3101 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.4 
 
 		 3176 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.24 
 
 		 2719 aa  580  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  44.19 
 
 		 1537 aa  580  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  37.51 
 
 		 6768 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 5400 aa  579  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.33 
 
 		 1909 aa  580  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  36.12 
 
 		 4111 aa  579  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.9 
 
 		 3111 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 		 3693 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 		 3693 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 		 3702 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 		 3493 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  38.65 
 
 		 4151 aa  568  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 		 3679 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 		 1354 aa  569  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  38.29 
 
 		 2108 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  42.91 
 
 		 3427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.79 
 
 		 1349 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.94 
 
 		 4080 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  39.98 
 
 		 3337 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  38.13 
 
 		 1820 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.46 
 
 		 5255 aa  563  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.89 
 
 		 1559 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  41.44 
 
 		 3355 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  37.06 
 
 		 3252 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 1816 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.89 
 
 		 1559 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>