More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4624 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 333 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  66.35 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  62.01 
 
 		 336 aa  341  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  55.02 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  50.62 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.07 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  42.06 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  40.43 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  42.47 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  39.81 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  51.39 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 		 134 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  41.13 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 252 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  29.41 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 630 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 630 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 141 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  42.16 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  49.3 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  31.31 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  42.19 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.88 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 165 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 429 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  41.79 
 
 		 132 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 147 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 134 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  34.29 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>