More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4310 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
203 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3777  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.91 
 
 
165 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  55.63 
 
 
184 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  51.66 
 
 
166 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  50.66 
 
 
167 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  48.67 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1234  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.39 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0250  flavin reductase-like, FMN-binding protein  50.99 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0240  flavin reductase domain-containing protein  50.99 
 
 
161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695925  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0260  flavin reductase domain-containing protein  50.99 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0925  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.66 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000199253  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  49.67 
 
 
170 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.98 
 
 
193 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  45.81 
 
 
172 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  43.61 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  44.37 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  42.86 
 
 
207 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.48 
 
 
311 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
226 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.1 
 
 
171 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.48 
 
 
311 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
172 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  35.29 
 
 
172 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
226 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
226 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  39.49 
 
 
172 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 
162 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.48 
 
 
306 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
156 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
156 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
327 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  39.88 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 
790 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4201  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
186 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.1 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  39.33 
 
 
175 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.16 
 
 
170 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
170 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.2 
 
 
162 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.41 
 
 
168 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  39.19 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
168 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 
311 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  36.49 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  34.93 
 
 
186 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.67 
 
 
175 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
175 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
175 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19380  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.29 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.711289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
309 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.9 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  32.99 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  35.53 
 
 
160 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  36.05 
 
 
162 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  37.41 
 
 
172 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 
184 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  39.06 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  31.43 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 
393 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  37.58 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.94 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
173 aa  84.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  38.56 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  40.67 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.82 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.38 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.29 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.65 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.11 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.16 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.76 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  35.37 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  31.82 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  31.52 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.14 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>